Wie Georgenzell im Tal des Rosabachs war auch St. Johannis ein Tochterkloster von Georgenzell. Das Priorat oder kleine Kloster wurde 1252 gegründet und konnte keine größere Bedeutung erlangen. Es lag im Tal des Sengelsbaches vor den Stadttoren von Eisenach und wurde wie die meisten thüringischen Klöster in der Reformation aufgehoben. Sichtbare Reste der Anlage haben sich nicht erhalten. Das Johannisthal ist heute ein bewaldetes Tal südlich von Eisenach. Eine kleine Tafel erinnert hier an das ehemalige Kloster.